İmidazol üretim prosesi sırasında, bir miktar atık suyun dışarıya deşarj edilmeden önce arıtılması gerekmektedir. Atık su arıtma işlemi şu şekildedir: Öncelikle bir atık su arıtma tankının olması gerekir. Kanalizasyon, kanalizasyon arıtma tankına deşarj edilir ve belirli bir süre kimyasal reaksiyona girdikten sonra içeride imidazol üretmek için kullanılan hammaddeler birbirleriyle reaksiyona girecek ve bu reaksiyonlar sonrasında bazı zararlı maddeler ortadan kaybolacaktır. Belli bir miktar çökelme sonrasında içerideki bazı katı maddeler havuzun dibine çökecektir ve bu katı maddeleri temizleyerek suyun çok daha berrak hale gelmesini sağlayabiliriz. Daha ileri reaksiyon arıtımı, az miktarda kimyasal madde içeren ve zararlı maddeleri uzaklaştırmak üzere arıtılabilen temiz su üretir. Çevre koruma departmanının artık imidazol üreticileri tarafından boşaltılan suya yönelik yüksek gereksinimleri var, bu nedenle her üreticinin eksiksiz bir çevre koruma ekipmanı seti satın alması gerekiyor.